Судя по всему, прошлые "мастера" не смогли провести адаптацию. На некоторых АБС от VAG кодирование и адаптация должны проходить одним процессом друг за другом, иначе не прокатит. Лучше это ОДИСом, можно и ВАСей, но как по мне, геморно.
Вряд ли вихревые.
Вот здесь у чела была такая же проблема. Если вкратце, ошибка в КП сохранялась, а в моторнике (по давлению топлива) удалялась после выключения зажигания. Пробуйте поймать ошибку,я бы еще в посмотрел в ОБД протоколе, там может остаться.