В ЭБУ нет проблем,замени свечи и заводи авто,либо оригинал либо Bosch +6 временно,другие по практике не прокатит...Повер не один авто отпустил после мастеров,не забудь отключит АКБ,пока не отключишь некакой сброс не поможет...
И для размышления транспондер в данном авто считается при включены зажигания,а после запуска уже иммо не в силе заглушит мотор,это не Ауди,а ключится у вас от помехи и теряется связи,ЭБУ уходит в защиту.
Убедится так,отключаешь АКБ на минуту,подключишь клему,стираеш сканером ошибки и убедишься что нет ошибок негде и увидишь что чек не мигает больше,значить с иммо все гуд.