В каком смысле коробки разные? Если вы меняете отдельно мехатрон это одно, если коробку в сборе это другое. Комп одинаковый, программируется под конкретный авто, мотор, железо коробки. Если заменили только мехатрон, или всю коробку в сборе с идентичным обозначением то просто делаете клон. А вот если железяка коробки другая, то сначало ищите прошивку под ваш авто, мотор, но уже с этой железякой коробки, если найдете то делаете клон, чтобы перенеслась иммодата а потом прошиваете найденной прошивкой. И потом еще адаптационная поездка с помошником.