В них защиты лицензии для свежих микроконтроллеров. Прошще говоря будет больше охват у программатора. На данный момент 1.38 отличается от 1,42 только наличием донгла а программатор в обеих случаях один и тот же с серийным номером 5С38. Ещё встречал в продаже донгл (так называемый 1.45) но пока на него не адекватный ценник. На старте продаж это нормальное явление.
На сколько я понял он прошивает удаленно эмулируя виртуальный USB порт, так что оставить у себя дамп прошивки не получится и не стоить верить в чудеса, вроде как все взрослые здесь, а такие глупые вопросы звучат... Для обновы требуется St-Link переделанный в J-Link.