Загрузчик (bootloader) защищен от считывания программатором. Считать загрузчик думаю можно тем же методом, как взломали программатор st-link. Написали свою прошивку, загрузили в адаптер, написали программу для компа, которая общается с этой прошивкой. Эта прошивка при запуске адаптера получила доступ ко всей памяти процессора и передала загрузчик на комп.