Ну он как проверяет: есть база с ебу, где для каждого блока есть адрес запроса и отклика (наличия). Скорее всего моторник некореткно отвечает. При ручном режиме программа шлет в кан запрос на изменение какого либо параметра и ждет ответ... Скорее всего косяк эбу. Клип какие ошибки видит по остальным блокам ? Именно цэкбс/uch/bcm ? Шнурок у вас красный оригинал ? Пробовали вытащить pin isk ?
Думаю тут 2 варианта, либо проводка, либо Сид залит... но может даже глюк Сид.