После прошивки FTDI с правильными вид и пид шнурок на перепрошивку все равно не вышел. Только определилась версия HW - 0.44. Подключился к прогеру через ISP. Атмегу увидело. После заливки флеш атмега перестала отвечать. Думал умерла. Да и епром не успел залить - шнурок был труп. Почив даташит решил попробовать подключиться чарез JTAG. Выпаял атмегу с адаптера и запаял на панельку. И на удивление атмега отозвалась. Пересмотрел фюзы. В прошивке флеши в формате HEX выставляло фюзы с отключением связи по ISP. Поменял фюз SPIEN. Прошил флеш, епром и фюзы. Защиту не ставил. Перепаял атмегу в адаптер - и все заработало. И диод, кстати, не светился, пока атмега после неудачной прошивки флеши не заработала. Сейчас диод засветился и красным, и зеленым