Естественно, такие огромные отломы смысла раскидывать по папкам нет.
Если вдруг кому интересно, то в таком случае проблема решается с помощью команды ln. На диске будет лежать только один файл adap.ver, а из всех папок с марками на него будет ссылка, которая ничего не весит.
Подробнее про команду - https://losst.ru/simvolicheskie-i-zhestkie-ssylki-linux#i